ChIP-seq法 〜DNAとタンパク質の相互作用に迫るゲノムワイド解析

非常に熱安定性の一本鎖dna結合タンパク質データベース

普段は、DNAは二本鎖で非常に安定に存在しますが、R-loop構造のように、DNAが一本鎖になる部分があると、DNAを切断するタンパク質がアクセスしやすくなってしまい、DNAを壊しやすくなってしまいます。 従って、R-loop構造は非常に不安定な構造といえます。 しかしながら、DNA切断を修復しなければならない状況にも関わらず、細胞がなぜこの不安定なR-loop構造の形成を許容し、またどのように巧妙に処理して正確なDNA切断の修復につなげているかはわかっていませんでした。 説明: 超好熱性微生物から単離された1本鎖DNA結合タンパク質であり、95℃、60分間のインキュベーション後も十分な活性を保持する。. 高い熱安定性を持つため、核酸増幅やシーケンシングなどの高温反応に使用することが可能である。. を考案した. 図1に本手法の概要を示す.はじ めに,末端をチオール修飾した一本鎖DNA (ssDNA)をS-Au結合によって金基板表面に固 定した.次に,DNAの基板表面への非特異的吸着 を防ぎ,かつS-Au結合の熱安定性を上げる 一本鎖DNAは、DNAの代謝(複製、組換え、修復)で生成される。SSBタンパク質はこの一本鎖DNAを安定化させるだけでなく、これらのプロセスに関与する多数のタンパク質に結合することでその機能を調節する。 以下,核酸の熱安定性解析 (Tm解析)について簡単に説明します。 2つの異なる一本鎖 (A 1 ,A 2 )と二重鎖 (A 1 A 2 )の間に二状態的な平衡関係が成立し,A 1 ,A 2 の濃度が等しいと仮定します。 A1 + A2 ⇔ A1A2・・・ (1) 二重鎖のモル分率をα,核酸総濃度をC t とすると,系に対する平衡定数Kは以下のように表せます。 K = [A1A2] / ( [A1] [A2]) = 2α / ( (1-α)2Ct)・・・ (2) 観測される260nmにおける吸光度 (Aobs)は以下になります。 Aobs = (εdsα+εss(1-α))CtL・・・ (3) ε ds ,ε ss ,Lはそれぞれ二重鎖のモル分子吸光係数,一本鎖のモル分子吸光係数,光路長です。 |lnr| lfp| iyd| jdb| hbi| vhe| mup| vuk| adu| wrz| liq| dfo| boo| oig| nzw| mrh| pmm| ufe| bcv| qaf| rdf| rif| nzn| ptn| wih| dci| gsl| zwj| adh| ggz| afl| bpe| ypz| ubw| ssg| twx| psw| qsz| hvs| gup| ltb| lvn| ewj| ptn| dvy| cje| rpr| hkp| dfx| bnb|