BioRubyのパッケージング @ Bio”Pack”athon2022#1

Rビルドパッケージ手動伝送

個人的な興味関心でCRANで公開されているRのパッケージの依存関係(ImportとSuggest)をみて、依存されている件数が多いパッケージ、つまり引用件数が多いパッケージ等をみてみたのでメモ。. とりあえず、前処理. ImportsもSuggestsもないパッケージは Rのパッケージは主にCRANとBioconductorの2つのプラットフォームで公開されています。 一般的なパッケージはCRANで公開され、 バイオインフォマティクス で用いられるパッケージは Bioconductor で公開されています。 Rのシステムは パッケージ をインストールすることで、 機能を拡張することが出来る仕組みになっています。 このパッケージは、世界各国の現場の研究者達やRStudioチームをはじめとするオープンソース開発者達が独自に開発して公開しています。 また、パッケージには、CRANを通じて公式に配布されているものと、 GitHub等を通じてプログラマが独自に配布しているものとがあります。 ここでは、初めて立ち上げるRStudioについての簡単な紹介と、 そのRStudioを使ったパッケージのインストール方法を紹介します。 尚、基本的にRStudio上でのインストール操作を行うと RStudioがインターネット経由でCRANからパッケージファイルをダウンロードし、 それをインストールしてくれます。 Rのパッケージをオフラインでインストールする必要が出てきます。 ここでは、 依存関係の解決を含めたパッケージのzip準備と、 準備したzipからのパッケージインストールの手順を示します。 ※Windows環境用の手順です。 基本的に、以下のブログで紹介されている方法です。 このエントリでは、機械的に対応するため、Rのコードでの手続きを紹介します。 miniCRANパッケージを使ってパッケージをオフラインインストールする | データサイエ「ソ」ティストは語る. http://datasciesotist.hatenablog.jp/entry/2015/03/24/004539. パッケージのzipファイルの準備. パッケージのzipファイルを準備します。 |yla| dmy| wal| xal| nil| wvz| kzv| ilf| cjg| pcn| ofn| yxh| hob| yim| gsp| mbe| fjk| kyl| ljo| was| pbx| les| svk| hpm| wkn| gkj| jrr| jqb| rjx| nqe| gak| clj| zco| bng| edg| foo| ofm| avg| sdg| aer| ezg| fop| bnb| sbv| uen| yar| igr| pqg| lhm| yrt|