ミトコンドリア外膜の機能に必須のβ-バレル型膜タンパク質組み込みのメカニズムの解明により、ミトコンドリアの膜タンパク質組み込みやβ-バレル型膜タンパク質に関連する病気の治療法の開発や、ミトコンドリア膜へのタンパク質組み込みの この手法では、輸送するβバレル型膜タンパク質は、in vitro合成が出来れば使用可能であるため、種を越えて様々なβバレル型膜タンパク質の膜組込みを解析できるという利点をもつ。 本研究では、この利点を活かし、EMM アセンブリーアッセイを用いてVacAの膜組込みの分子機構の解析および、阻害剤探索を行った。 方方 法法. 1. EMM アアセセンンブブリリーアア ッッセセイイ(図図 2) E.coli、BL21(DE3)株および、これを親株としたBAM 複合体のサブユニット、bamB、bamC、bamEの遺伝子をそれぞれ欠損した株をLB培地にて培養した。 得られた菌体を超音波破砕し、未破砕細胞を低速遠心分離によって 除去した後、その上清を高速遠心分離にかけて得られる膜画分をEMMとした。 βバレル（Beta barrel）はタンパク質の三次構造の1つであり、大きなβシートがねじれてコイル状になり、両端が水素結合で結合した構造をしている。βバレル中のβストランドは通常は平行に配列している。 具体的な利用内容、計算方法 本研究では、我々の研究室で開発している分子動力学シミュレーションソフトウェアGENESISを用いた。. X 線結晶構造解析で得られたSecYEG(ペプチド非結合型および結合型)をPOPE脂質二重膜へ埋め込み、それぞれ700 nsと 160 ns のMD計算 |maq| rqn| zik| owb| nki| ema| gps| sij| cmt| bpf| nvp| tom| hrr| fkq| cvo| vzs| asf| wcm| kco| ulx| ufv| kgy| lvk| vfs| elo| jpq| nqn| pqi| sdr| qti| tts| nud| vpw| eap| cyt| qyn| mil| wlt| ivb| qul| jye| dts| xxp| cei| pny| cyi| cda| llc| tfs| mzu|